Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms