Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NESP48681 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NESP48681 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NESP48681 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NESP48681 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms