Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms