Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms