Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL1P40616 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL1P40616 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms