Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFBP38117 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFBP38117 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFBP38117 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFBP38117 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFBP38117 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFBP38117 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFBP38117 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFBP38117 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETFBP38117 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETFBP38117 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETFBP38117 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETFBP38117 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms