Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SPRR1AP35321 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms