Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms