Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN4P29074 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN4P29074 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms