Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms