Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms