Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms