Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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DEFA4P12838 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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DEFA4P12838 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DEFA4P12838 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DEFA4P12838 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DEFA4P12838 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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