Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC192P0DO97 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms