Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms