Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms