Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALUO43852 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALUO43852 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALUO43852 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALUO43852 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALUO43852 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALUO43852 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALUO43852 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALUO43852 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALUO43852 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALUO43852 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALUO43852 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALUO43852 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALUO43852 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALUO43852 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALUO43852 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALUO43852 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CALUO43852 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALUO43852 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms