Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP4-16G5E9R7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms