Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms