Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPS5Q9UPZ3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms