Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1BQ9UPS6 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms