Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT11Q9UKZ1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms