Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms