Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB6

LIMA1, LIM domain and actin-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMA1Q9UHB6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIMA1Q9UHB6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms