Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms