Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GIN1Q9NXP7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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