Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms