Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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