Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A16Q9GZN6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A16Q9GZN6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms