Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms