Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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