Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms