Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1049.6 ms