Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF479Q96JC4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms