Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMA16Q96EY4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMA16Q96EY4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms