Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms