Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRTOMTQ8WZ04 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRTOMTQ8WZ04 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms