Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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