Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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