Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX32Q86XE0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms