Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms