Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms