Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms