Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP9Q5VTM2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms