Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIF1Q5UIP0 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms