Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDZK1Q5T2W1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms