Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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C10orf55Q5SWW7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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C10orf55Q5SWW7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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C10orf55Q5SWW7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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C10orf55Q5SWW7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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C10orf55Q5SWW7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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C10orf55Q5SWW7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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C10orf55Q5SWW7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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C10orf55Q5SWW7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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