Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT3Q5FWE3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms