Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG05

CARD16, Caspase recruitment domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD16Q5EG05 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARD16Q5EG05 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms