Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms